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生物统计与风险评估中心

促进和进行统计分析,数据挖掘和定量风险评估

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生物统计学和风险评估中心(BRAC)位于马里兰大学学院公园的公共卫生学院。我们的使命是在公共卫生和生物医学研究领域促进和开展统计分析、数据挖掘和定量风险评估。

部:流行病学和生物统计学
房间号:2234R.
导向器:梅凌

办公室电话号码:(301) 405 - 4581
电子邮件:mltlee@umd.edu

BRAC的主要目标是与调查员和研究机构合作,进行统计分析,生物信息性程序和量化风险评估。我们的目标是:

  • 与研究人员合作,在研究设计、样本量和功率计算、数据收集和数据管理、统计建模、生物信息学分析、统计结果解释、手稿准备和结果传播等方面提供帮助。
  • 采取领先地位开发新的和改进尖端多学科和翻译研究所需的生物统计和生物信息方法。
  • 为开发项目开发的新统计方法开发软件工具。

数据中心

生物统计和风险评估中心是多个研究项目的数据中心。我们的数据中心服务包括数据收集、数据管理、数据存储和数据分析。

我们有一个带有英特尔Xeon X3460四核处理器的Dell PowerEdge T310服务器和32GB的RAM内存。处理器的速度为2.8 GHz,具有8MB的缓存内存。服务器的硬盘存储容量为2 TBRABYTES(2000千兆字节)。数据会自动备份。硬件由Red Hat Enterprise Linux 5.3(64位)网络操作系统提供主动许可。计算机一直作为Web服务器(Apache Server)。我们有几个数据库管理系统,包括MySQL。我们将与调查人员讨论其需求,并为其项目使用最合适的数据库管理系统。

当前的研究项目

梅凌婷李,博士:
  • 基因组,蛋白质组学和测序数据分析
  • 癌症风险评估的阈值回归方法
  • 大豆杏仁面包作为前列腺癌的补充疗法
  • 眼科和集群数据的统计方法
陈烁博士:
  • 具有复杂的时空结构的高维生物医学数据的统计方法
  • 网络和统计图模型
  • 机器学习方法
  • 贝叶斯方法
  • 应用于神经影像学,OMNI-OMICS和环境健康数据分析
Raul Cruz-Cano,Ph.D.:
  • 规范相关性
  • 特征选择和尺寸减少技术
  • 数据分析
  • 统计编程
鑫他博士:
  • 反复事件数据分析
  • 面板计数数据的统计模型
  • 惩罚阈值回归分析
  • 润滑剂的使用与阴道微生物组的研究
  • 事件前的阴道微生物瘤纵向研究
  • 醛固酮抑制对杜氏肌营养不良症的治疗潜力
  • 常青藤联盟/十大运动中脑震荡流行病学研究
Chengsheng江博士:
  • 气候变化
  • 空间统计数据
  • 空气污染
  • GIS和Rs.
  • 环境采样
京张博士:
  • 网络元分析,广义证据合成
  • 贝叶斯等级模型,缺少数据分析
  • 临床试验的设计和分析
  • 机器学习

教员

梅凌婷李,博士中心主任
教授
流行病学与生物统计学系

守申,博士。
副教授,流行病学与公共卫生
马里兰大学医学院
马里兰精神病学研究中心生物统计和数据科学主任

Raul Cruz-Cano,博士。
助理研究教授
流行病学与生物统计学系

辛合成,博士。
副教授
流行病学与生物统计学系

成盛江,博士。
研究助理教授
马里兰州应用环境健康研究所

闫丽,博士。
副教授,
调查方法中的联合计划

闵齐王,博士。
教授
行为和社区健康部

京张博士。
助理教授
流行病学与生物统计学系

咨询委员会

维克多·德·格鲁托拉博士
教授
生物统计部
哈佛大学公共卫生学院

Mitchell H. Gail,医学博士,博士。
高级调查员
癌症流行病学和遗传学分裂
国家癌症研究所

罗伯特S.黄金
教授
公共卫生学院
马里兰大学

尼克珠宝,博士。
教授
生物统计数据和统计系
加州大学伯克利分校

图书
  1. 李M- lt, Gail M, Pfeiffer R, Satten G, Cai T, Gandy A,编辑,风险评估和预测评估,(2013)。Springer。
  2. 李m-lt。微阵列基因表达数据分析(2004),斯普林克(以前的Kluwer学术出版商)
  3. Mesbah M, Cole BF, LEE M- lt,编辑,生活质量研究设计、测量和分析的统计方法,(2002)。Springer(以前的Kluwer学术出版商)
  4. Jewell NP,Kimber Ac,Lee M-LT,Whitmore Ga,编辑,寿命数据:可靠性和生存分析中的模型,(1996)。Springer(以前的Kluwer学术出版商)
  5. 李,梅凌婷。微阵列基因表达数据分析(2004)。Springer。
同行评审在以下领域的文章

(最后更新于12/8/2014)

  1. 基因组数据分析
  2. 统计模型和应用概率
    • 统计模型
    • 应用概率
  3. 在流行病学、环境研究和微生物学中的应用
    • 流行病学
    • 环境研究
    • Pharmarco流行病学
    • 微生物学

基因组数据分析的文章

赵超英,荣杰,陈玮,周德,任华,贝南克,Amos CI, Liu A, Mills JL, Ting Lee ML, Xiong M, Fan R. quantitative multitropic traits for下一代测序的多元函数线性模型的meta分析。欧洲人类遗传杂志2016年12月21日doi: 10.1038 / ejhg.2016.170PMID:28000696

克鲁兹·卡诺,李·M-LT。快速典型相关分析,计算统计和数据分析,2014年,卷。70:88-100,doi: 10.1016 / j.csda.2013.09.020

Guth LM, Ludlow AT, Witkowski S, Marshall MR, Lima LCJ, Venezia AC, Xiao T, Lee M-LT, Spangenburg EE, Roth SM。运动祖先对多代小鼠后代代谢、形态和基因表达表型的性别特异性影响,实验心理学, 2013, 98(10):1469-1484。doi: 10.1113 / expphysiol.2012.070300PMID: 23771910PMCID: PMC3783594

Cruz-Cano R,Lee M-LT,Leung My。逻辑最小化和规则提取,用于鉴定分子序列中功能位点,生物数据挖掘,2012年,卷。5:10。PMID:22897894PMCID: PMC3492099

Beyer SJ,Zhang X,Jimenez Re,Lee M-LT,Richardson Al,Huang,Jhiang Sm。乳腺癌中细胞表面NIS蛋白水平相关的基因的微阵列分析。BMC研究笔记,2011年,卷。4:397-410。DOI:10.1186 / 1756-0500-4-397,PMID:21989294PMCID: PMC3205061

李M-LT。分子基因 - 签名和癌症临床试验:临床试验设计:目前问题的观点。大卫·哈林顿,编辑,2011,139-155。

作者:张旭,李玉杰,余磊,肖涛,Schafer J, Lee M-LT, Schmittgen TD, Nana-Sinkam SP, Jarjoura D, Marsh C.外周血微泡中microRNA表达的检测普罗斯一体, 2008, Vol. 3: 11, e3694。PMID: 19002258PMCID: PMC2577891

Zhang Y, Bertolino A, Fazio L, Blasi G, Rampino A, Romano R, Lee M-LT, Xiao T, Papp A, Wang D, and Sadée W. human多巴胺D2受体基因的新多态性对工作记忆中的基因表达、剪切和神经元活动的影响,美国国家科学院院刊中国海洋大学学报(自然科学版)PMID: 18077373PMCID:PMC2154469.

邱W,李M-lt。SPCALC:微阵研究中的基于Web的样本大小和功率计算的计算器,生物信息, 2006, 1: 251-252。PMID:17597901PMCID:PMC1891702

秦S,邱W,EHRLICH JR,Ferdinand As,Richie JP,O?Eary MP,Lee M-LT,Liu BC-S。逆转捕获自身抗体微阵列的发展,用于研究抗原自身抗体分析。蛋白质组学, 2006, 6: 3199-3209。PMID:16596707

李M-LT, Whitmore GA, Bjorkbacka H, Freeman M.基于可交换性和外引功率的微阵列数据非参数化方法。生物制药统计学报, 2005, 15: 783-797。PMID:16078385

蔡PW,李M-LT。分裂图微阵列实验:设计、功率和样本量的问题。应用生物信息学, 2005, 4: 187-194。PMID: 16231960

Lee M-LT,Gray RJ,Bjorkbacka H,Freeman MW。复制的微阵列数据的广义等级测试。遗传学和分子生物学中的统计应用, 2005,第4卷第1期,第3条。PMID:16646848

Lee M-LT, Whitmore GA。微阵列分析中的强度依赖性标准化:一个关注的备忘录。伯努利, 2004, 10: 943-949。

Lee M-LT,Whitmore Ga,Yukhananov Ry。分析不平衡的微阵列数据,数据科学杂志, 2003;1: 103 - 121。

Lee M-LT, Whitmore GA。微阵列研究的功率和样本量,医学统计, 2002;21日:3543 - 3570。PMID:12436455

Lee M-LT,Bulyk Ml,Whitmore Ga,Church Gm。使用微阵列研究DNA核苷酸序列的结合概率的统计模型,生物识别学, 2002;58: 981 - 988。PMID: 12495153

Lee M-LT,Lu W,Whitmore Ga,Beier D.微阵列基因表达数据的模型,生物制药统计学报, 2002;12:1-19。PMID: 12146717

引用本文:李志刚,李志刚,李志刚。复制在微阵列基因表达研究中的重要性:统计方法和重复cDNA杂交的证据。美国国家科学院院刊, 2000;97: 9834 - 9839。PMID:10963655PMCID:PMC27599

统计模型

陈勇,刘永强,李廷明,施密德CH(2017)。一个简单和稳健的多变量元分析诊断测试准确性的方法。医学统计36(1):105-121。DOI:10.1002 / SIM.7093PMID: 27580758

侯文华,庄慧颖,李m - lt(2016)。创伤性肢体损伤后恢复工作的阈值回归模型。受伤,2016;47:483 - 489。2015年12月2日。DOI:10.1016 / J.Injury.2015.11.032PMID:26746983

肖涛,何旭,李M-LT(2015)。实现阈值回归模型的R包线程,统计软件学报,第66卷,第8期。http://www.jstatsoft.org/article/view/v066i0

(in chinese with chinese abstract)[何旭,陈磊,雷磊,夏夏,Lee MLT(2015)一种估算暴露校正发病率置信区间的简单方法及其在临床试验中的应用。生物识别与生物统计学学杂志,第6卷:238。doi: 10.4172 / 2155 - 6180.1000238

He X, Whitmore GA, Loo GY, Hochberg MC, Lee M-LT。(2015).冲击流叠加在渐进降解上的骨折时间模型:骨质疏松性骨折的研究。医学统计, Vol.34 (4):652- 663DOI:10.1002 / SIM.6356。PMID: 25376757

邵福,李吉,马,李M-LT(2014)。半导体变化系数模型,间隔删除了具有固化比较的数据。医学统计, Vol.33(10): 1700 - 12所示。DOI:10.1002 / SIM.6054PMID: 24302535

惠族,张克,李m-lt。使用阈值回归混合模型构建出生体重和妊娠期常规和差异指标。生物识别学,2012,68:297-306。PMID: 21838731

肖T,惠特莫尔,何x,李M-LT。在STATA中实现阈值回归模型的新命令。占据日报,2012,12(2):257-283。

Li L,Lee M-LT。利用半参数变形系数的阈值回归分析失效时间。Statistica Neerlandica,2011,65:164-182。

Lee M-LT,Whitmore Ga,Rosner B.具有时变协变量的生存数据的阈值回归。医学统计,2010,29,7-8:896 - 905。PMID: 20213704PMCID: PMC3063107

Lee M-LT, Whitmore GA。比例危害和阈值回归:它们的理论和实用联系。终身数据分析, 2010, 16, 2: 196-214。PMID: 19960249

Pennell M,Whitmore Ga,Lee M-LT。贝叶斯随机效应阈值回归与申请生存数据,具有非营利性危险。生物统计学,2010,11,1:111-126。PMID:19828558

yu z,tu w,lee m-lt。青少年女性性传播感染的半甲阈值回归分析。医学统计, 2009年,28:3029 - 3042。PMID:19691037

一种阈值回归混合模型用于评估多发性骨髓瘤临床试验的疗效。生物制药统计学报,2008,18:1136-1149。PMID:18991113

桐x,他x,sun j和lee m-lt。电流状态和标记数据的联合分析:双变阈值模型的延伸。国际生物统计学杂志, 2008, Vol. 4: Iss. 1, Article 21。PMID:20231913PMCID: PMC2835457

李M-LT。寿命模型和风险评估。定量风险评估百科全书,2008年在线发布。DOI:10.1002 / 9780470061596.RISK0478

Lee M-LT, Whitmore GA。存活分析的阈值回归:通过随机过程建模事件时间到达边界。统计科学, 2006, 21: 501-513。

Rosner B, Glynn RJ, Lee M-LT。聚类数据秩和检验的扩展:在亚单位水平上定义组成员的两组比较。生物识别学, 2006, 62: 1251-1259。PMID: 17156300

Rosner B, Glynn RJ, Lee M-LT。聚类数据配对比较的Wilcoxon符号秩检验。生物识别学,2006,62:185-192。PMID: 16542245

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Shubina M.,Lee M-LT。关于SARMANOV系差异分布的最大达到相关性,具有平等边际分布,统计通信:理论与方法, 2004, 33: 1031-1052。

采用Wilcoxon秩和检验的聚类效应:一个大样本方法。生物识别学, 2003;59:1089-1098。PMID:14969489.

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Hougaard P,Lee M-LT,Whitmore Ga。泊松变量和泊松过程混合物的过分分离计数数据分析。生物识别学, 1997;53: 1225 - 1238。PMID: 9423246

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李M-LT。二元分布Sarmonov族的性质及应用。统计通信:理论与方法, 1996;25:1207-1222。

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Benedetti J,Green S,Lee M-LT,Crowley J. Ad Hoc委员会关于双盲裁判实验设计的报告。统计科学,1993年;8:318-30。

李·M-LT,格罗斯·AJ。在未知环境下的寿命分布。统计规划与推理杂志, 1991;29:137-43。

惠特莫,李m-lt。由逆高斯混合的指数产生多变量的存活分布。技术计量学, 1991;33:39-50。

D'Agostino RB,Lee M-LT,Belanger AJ,Cupples La,Anderson K,Kannel WB。汇总物流回归时间依赖于Cox回归分析的关系:Framingham心脏研究。医学统计1990年;9:1501-15。PMID:2281238

李M-LT。识别均匀性的时刻测试。统计通信:模拟和计算, 1989;18份B:253-61。

李M-LT。一些横向产品差异统计数据和有序应急表趋势的测试。统计与概率字母, 1988;7:41-46。

阻止HW,婷毫升。一些多变量依赖的概念。统计通信:理论与方法, 1981;A10(8): 749 - 62。

应用概率

Limnios N,Lee M-LT。Hoeffding的鞅和半马尔可夫进程的不平等。统计通信:理论与方法,2005,34:713-720。

Lee M-LT, Whitmore GA。由随机时间指导的随机过程。应用概率杂志,1993年;30:302-14。

稳定随机变量的关联。概率史1990年;18:1759-64。

李·M-LT,格罗斯·AJ。条件独立广义分布的性质。工程和信息科学的概率, 1989;3:289 - 97。

李M-LT。依赖逆转规则。概率史, 1985;13:583 - 91。

李M-LT。依赖总积极性。概率史, 1985;13:572-82。

王hc,ting ml。局部可分配功能的同质Banach空间。南塔Mathematica 1979;12:62-70。

流行病学,药物流行病学,微生物学;环境研究

流行病学

Lin Sc,Lee ML-T,Adirim Ta,残疾人的年轻成年人的过渡结果,儿科康复医学杂志:跨学科方法, 2015, Vol. 8:23-30,PMID: 25737345

Beksinska Me,Smit J,Greener R,Todd CS,Lee ML-T,Maphulo V,Hoffmann V,南非月经杯的可接受性和性能:随机交叉试验比较月经杯或卫生垫,妇女健康杂志,2015年,Vol.24(2):151-158。PMID:25682816.

何旭东,吕晓东,陈森,何志强,陈志强。肥胖、种族与膝骨关节炎的关系:多中心骨关节炎研究。国际医学研究统计杂志3卷,2014 (3):224 - 230

何宗杰,车吉吉,朴美,李M-LT,朴ys。基于遗传算法的子宫颈完全扩张时间估计高雄医学杂志, 2012年8月;28日(8):423 - 428。PMID:22892163

Rosner B, Glynn RJ, Lee M-LT。具有眼特异性曝光和结果的观察非正常分布眼科数据的非参数测试,眼科流行病学,2007年7月;14(4):243-250。PMID:17896304

Finkelstein JS, Lee M-LT, Sowers MF, Ettinger B, Neer RM, Kelsey JL, Cauley JA, Huang MH, Greendale GA。绝经前和围绝经期早期妇女骨密度的种族差异:人体测量和生活方式因素的影响,临床内分泌与代谢杂志, 2002;87:3057-3067。PMID: 12107201

Finkelstein JS,Sowers MF,Greendale Ga,Lee M-LT,Neer RM,Cauley Ja,Ettinger B.妇女前期和早期妇女骨质骨质骨质种族的种族变异:人类学测量和生活方式因素的影响。临床内分泌与代谢杂志, 2002;87:3051-3056。PMID: 12107200

Leder BZ,Smith Mr,Fallon M,Lee Ml,Finkelstein JS。性腺类固醇抑制对男性甲状旁腺激素骨骼敏感性的影响。临床内分泌和新陈代谢杂志CHINESE, 2001;86: 511 - 516。PMID: 11158001

Zaleznik DF, Rench MA, Hillier S, Krohn MA, Platt R, Lee M-LT, Flores AE, Ferriri P, Baker CJ。来自不同人群的孕妇和新生儿的侵入性B组链球菌病临床感染疾病, 2000;30:276 - 281。PMID: 10671328

Lee M-LT,Rosner Ba,Weiss St.血压与心血管死亡的关系:老年人脉压的影响。流行病学年报, 1999;9: 101 - 107。PMID:10037553

Platt R, Adelson-Mitty J, Weissman L, Zaleznik D, Lee ML, Baker CJ。早期发病的B组链球菌疾病使最初住院时间的资源利用复杂化。儿科传染病,1999年;18: 529 - 533。PMID: 10391183

Lee M-LT, Rosner BA, Weiss ST, Vokonas PS, Gaziano JM。心血管死亡的预测因素:规范老化研究——1963-1998。临床老年特性, 1999: 7: 77-85。

Fireming Jr,Griffiths DJ,Versi E,Mulkern RV,Lee M-LT,Jolez Fa。仰卧和坐姿骨盆楼陆陆机制的先生成像。美国人杂志杂志, 1998;171: 1607 - 1610。PMID: 9843296

Poteat HT, Ho GT, Lee M-LT, Welch WR, Loughlin KR, Sacks DB。患者年龄在评估前列腺癌中的效用,美国临床病理学杂志, 1997;107: 337 - 344。PMID: 9052385

成年男性血压的纵向分析:正常年龄研究,1963-1992。流行病学与生物统计学学报, 1996;1:79 - 87。

Hirschorn LR,Trnka Y,Onderdonk A,Lee M-LT,Platt R.社区获得的Clostridium差异相关腹泻的流行病学。传染病杂志, 1994;169:127-33。PMID: 8277174

环境研究

Pasturel BZ, Cruz-Cano R, Rosenberg Goldstein, Palmer A, Blythe D, Ryan P, Hogan B, Jung C, Joseph SW, Wang MQ, Lee M-LT, Puett R, Sapkota AR.农村环境、肉鸡操作和社区社会经济因素对马里兰州弯曲菌病风险的影响,美国公共卫生杂志,2013,103(12):2267-75。DOI:10.2105 / AJPH.2013.301338,PMID: 24134343

基于阈值回归模型的铁路工人死亡与柴油废气暴露的病例对照研究。统计规划与推理杂志,2009,139:1633-1642。PMID: 19221608PMCID: PMC2642623

Lee M-LT,Whitmore Ga,Laden F,Hart Je,Garshick E.使用第一个击中时间回归模型评估铁路工人的肺癌风险。环境识别,2004,15:501-512。PMID:16741563

中老年男性骨铅、血铅与肾功能关系的研究。环境健康观点。2004;112:1178-82。

利用电感耦合等离子体质谱法测定K - x射线荧光骨铅。医学物理学, 2000;27:119-123。PMID:10659745.

Chuang Hy,Schwartz J,Hu H,Lee M-LT。长期铅曝光工人的振动感知阈值。职业与环境医学, 2000;57:588-594。PMID: 10935939PMCID: PMC1740022

Tsaih Swt,Schwartz J,Lee M-LT,Amarasiriwardena C,Aro A,Sparrow D,Hu H.骨骼和红细胞的独立贡献导致中年和老年人的泌尿铅:规范性老化研究。环境健康观点, 1999;107年,391 - 396。PMID: 10210695PMCID:PMC1566410

Chuang Hy,Lee M-LT,Chao Ky,Wang JD,胡H.铅电池工人血铅水平与个人卫生习惯的关系:台湾,1991-1997。美国工业医学杂志, 1999;35:595-603。PMID: 10332513

Pharmarco流行病学

Clinton Sk,Ahn-Jarvis JH,Grainger Em,Riedl K,Schwartz Sj,Lee ML-T,Cruz-Cano R,Young GS,Lesinski GB,Vodovotz Y. oisoflavone药代动力学和代谢在消耗标准化大豆和大豆杏仁之后面包在有无症状前列腺癌的男性。癌症预防研究,第8卷(11),页面1045-1054。2015年8月,doi: 10.1158 / 1940 - 6207. - capr - 14 - 0465PMCID:PMC4633369.PMID: 26276749

Choo PW, Rand CS, Inui TS, Lee M-LT, Canning C, Platt R.一项关于抗高血压依从性过度报告可能危险因素的队列研究,生物医学中央心血管障碍, 2001;1:6。PMID: 11801191PMCID:PMC64641

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微生物学

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